TRAF1-C5 jako locus ryzyka dla reumatoidalnego zapalenia stawów – badanie genomewidu

Reumatoidalne zapalenie stawów ma złożony tryb dziedziczenia. Chociaż HLA-DRB1 i PTPN22 są ugruntowanymi locus podatności, niedawno zidentyfikowano inne geny, które dają umiarkowany poziom ryzyka. Przeprowadziliśmy analizę asocjacji genomewidu w celu zidentyfikowania dodatkowych loci genetycznych związanych ze zwiększonym ryzykiem reumatoidalnego zapalenia stawów. Metody
Genotypowaliśmy 317 503 polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) w połączonym badaniu kliniczno-kontrolnym z udziałem 1522 pacjentów z rozpoznaniem reumatoidalnego zapalenia stawów i 1850 dopasowanych osób z grupy kontrolnej. Pacjenci byli seropozytywni pod względem autoprzeciwciał przeciwko cyklicznemu cytrulinowanemu peptydowi (CCP). Uzyskaliśmy próbki z dwóch zestawów danych: North American Reumatoid Arthritis Consortium (NARAC) i szwedzkiego badania epidemiologicznego reumatoidalnego zapalenia stawów (EIRA). Wyniki NARAC i EIRA dla 297 086 SNP, które przeszły filtry kontroli jakości połączono z zastosowaniem stratyfikowanej analizy Cochrana-Mantela-Haenszela. SNP wykazujące znaczący związek z chorobą (P <1 × 10-8) genotypowano w niezależnym zestawie pacjentów z rozpoznaniem reumatoidalnego zapalenia stawów z anty-CCP (485 z NARAC i 512 z EIRA) oraz u osób kontrolnych (1282 z NARAC i 495 z EIRA).
Wyniki
Zaobserwowaliśmy powiązania między chorobą a wariantami w locus kompleksu głównego histokompatybilności, w PTPN22, oraz w SNP (rs3761847) na chromosomie 9 dla wszystkich badanych próbek, drugie z ilorazem szans 1,32 (przedział ufności 95%, 1,23 do 1,42; P = 4 x 10-14). SNP znajduje się w nierównowadze sprzężeń z dwoma genami związanymi z przewlekłym zapaleniem: TRAF1 (kodującym czynnik związany z receptorem czynnika martwicy nowotworu 1) i C5 (kodujący składnik 5 dopełniacza).
Wnioski
Powszechny wariant genetyczny w locus TRAF1-C5 na chromosomie 9 jest związany ze zwiększonym ryzykiem reumatoidalnego zapalenia stawów z anty-CCP.
Wprowadzenie
Reumatoidalne zapalenie stawów jest częstym zapalnym zapaleniem stawów o nieznanej przyczynie, w którym wplątywano zarówno genetyczne, jak i środowiskowe czynniki ryzyka. [3] Genetyczny wkład w podatność na reumatoidalne zapalenie stawów wykazano w badaniach bliźniąt4 i rodzin5 oraz w skanach powiązań między genomami. 6-11
Dwa geny wykazały silny związek z podatnością: PTPN22 12,13 i HLA-DRB1.14 Warianty każdego genu zwiększają ryzyko głównie dla podgrupy ciężkiego reumatoidalnego zapalenia stawów charakteryzującego się obecnością autoprzeciwciał przeciwko cyklicznemu cytrulinowanemu peptydowi (anty-CCP- dodatnie) .12,15,16 Niedawno donieśliśmy o znaczącym związku w STAT4 na chromosomie 2q.17 W literaturze opisano kilka innych obiecujących genów kandydujących (np. CTLA4 i PADI4), ale te geny miały bardziej skromne dowody statystyczne asocjacji.18,19 Wszystkie allele związane z reumatoidalnym zapaleniem stawów występują często u zdrowych osób o europejskim pochodzeniu (częstość alleli,> 5%). Dlatego wydaje się prawdopodobne, że dodatkowe typowe warianty genetyczne o niewielkiej wielkości efektu (np. Iloraz szans, <1,5 na kopię) pozostaną do odkrycia.
Testy statystyczne oparte na częstości alleli w badaniach kliniczno-kontrolnych (analizy asocjacyjne) mają więcej możliwości identyfikowania wspólnych alleli, które niosą ze sobą niewielkie ryzyko niż testy oparte na segregacji chromosomów w rodzinach (analizy sprzężeń) .21 Do niedawna badania dotyczące asocjacji genetycznej były ograniczone do małych regionów genomu zawierających geny będące kandydatami biologicznymi lub zidentyfikowanych w badaniach opartych na rodzinach
[hasła pokrewne: hashimoto objawy psychiczne, niedomykalność zastawki aortalnej, tmt wadowice ]

Ten wpis został opublikowany w kategorii Bez kategorii i oznaczony tagami , , . Dodaj zakładkę do bezpośredniego odnośnika.

0 odpowiedzi na „TRAF1-C5 jako locus ryzyka dla reumatoidalnego zapalenia stawów – badanie genomewidu

  1. Chocolate Thunder pisze:

    Article marked with the noticed of: chlorella[…]

  2. Miłosz pisze:

    Mają nowoczesny sprzęt co również jest ważne wykonując takie badanie

  3. Eliza pisze:

    [..] Cytowany fragment: szkolenia dla lekarzy[…]

  4. Shooter pisze:

    Ludzie są chronicznie zmęczeni